Condition Associated Bacteria -

The following are reported associated when too high or too low.

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Condition  Rank  Taxonomy  Shift   Study
Acne   class    Bacteroidia     H   Source  
  Clostridia     L   Source  
 family    Lachnospiraceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Allobaculum     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Butyricicoccus     L   Source  
  Coprobacillus     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
 order    Clostridiales     L   Source  
 phylum    Actinobacteria     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
ADHD   class    Acidobacteriia     H   Source  
  Clostridia     L   Source  
  Deltaproteobacteria     L   Source  
 family    Bifidobacteriaceae     H   Source  
  Catabacteriaceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Neisseriaceae     H   Source  
  Porphyromonadaceae     H   Source  
  Prevotellaceae     L   Source  
  Rikenellaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Acetivibrio     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Eggerthella     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Neisseria     H   Source  
  Odoribacter     H   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Subdoligranulum     L   Source  
 order    Bifidobacteriales     H   Source  
  Clostridiales     H   Source  
  Clostridiales     L   Source  
  Desulfovibrionales     L   Source  
 phylum    Actinobacteria     H   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    Bifidobacterium adolescentis     H   Source  
  Bifidobacterium longum     H   Source  
  Brucella tularensis     L   Source  
  Coprococcus eutactus     L   Source  
Allergic Rhinitis (Hay Fever)   species    Clostridium butyricum     L   Source  
Allergies   class    Acidobacteriia     H   Source  
  Clostridia     H   Source  
  Clostridia     H   Source  
 family    Bacteroidaceae     H   Source  
  Comamonadaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     L   Source  
  Methylobacteriaceae     H   Source  
  Sphingomonadaceae     H   Source  
 genus    Clostridium     L   Source  
  Enhydrobacter     H   Source  
  Faecalibacterium     H   Source  
  Lachnoclostridium     H   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Methylobacterium     H   Source  
  Propionibacterium     H   Source  
 phylum    Actinobacteria     H   Source  
  Firmicutes     H   Source  
 species    Akkermansia muciniphila     L   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bifidobacterium adolescentis     L   Source  
  Bifidobacterium bifidum     H   Source  
  Bifidobacterium catenulatum     H   Source  
  Bifidobacterium longum     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Clostridioides difficile     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Oscillibacter valericigenes     H   Source  
  Staphylococcus aureus     L   Source  
Alzheimer's disease   family    Bifidobacteriaceae     L   Source  
  Clostridiaceae     L   Source  
  Erysipelotrichaceae     L   Source  
  Peptostreptococcaceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Adlercreutzia     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Bacteroides     H   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bilophila     H   Source  
  Blautia     H   Source  
  Clostridium     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Eubacterium     L   Source  
  Gemella     H   Source  
  Mogibacterium     L   Source  
  Phascolarctobacterium     H   Source  
  Turicibacter     L   Source  
 species    [Eubacterium] rectale     L   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) Motor Neuron   family    Enterobacteriaceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     H   Source  
 genus    Anaerostipes     H   Source  
  Dorea     H   Source  
  Oscillibacter     H   Source  
  Peptostreptococcus     L   Source  
  Ruminococcus     L   Source  
 phylum    Cyanobacteria     H   Source  
 species    Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     B   Source  
  Butyrivibrio fibrisolvens     L   Source  
Ankylosing spondylitis   class    Acidobacteriia     H   Source  
  Bacilli     H   Source  
  Bacilli     L   Source  
  Clostridia     L   Source  
  Coriobacteriia     L   Source  
  Dothideomycetes     H   Source  
 family    Acidaminococcaceae     L   Source  
  Atopobiaceae     H   Source  
  Bacteroidaceae     H   Source  
  Bacteroidaceae     L   Source  
  Barnesiellaceae     L   Source  
  Candidatus Homeothermaceae     L   Source  
  Christensenellaceae     L   Source  
  Clostridiaceae     L   Source  
  Coriobacteriaceae     H   Source  
  Eggerthellaceae     H   Source  
  Elusimicrobiaceae     L   Source  
  Enterobacteriaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     L   Source  
  Enterobacteriaceae     L   Source  
  Erysipelotrichaceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Oscillospiraceae     L   Source  
  Peptococcaceae     H   Source  
  Porphyromonadaceae     H   Source  
  Prevotellaceae     L   Source  
  Rikenellaceae     H   Source  
  Rikenellaceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
  Veillonellaceae     L   Source  
 genus    '     L   Source  
  '     L   Source  
  Abiotrophia     H   Source  
  Acinetobacter     L   Source  
  Actinomyces     H   Source  
  Actinomyces     H   Source  
  Agathobacter     L   Source  
  Aggregatibacter     H   Source  
  Agromonas     L   Source  
  Akkermansia     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Anaeromassilibacillus     H   Source  
  Angelakisella     L   Source  
  Bacillus     H   Source  
  Bacillus     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Blautia     H   Source  
  Blautia     H   Source  
  Butyricicoccus     H   Source  
  Butyricimonas     L   Source  
  Butyrivibrio     L   Source  
  Candidatus Homeothermus     H   Source  
  Candidatus Stoquefichus     L   Source  
  Capnocytophaga     H   Source  
  Cardiobacterium     H   Source  
  Centipeda     L   Source  
  Centipeda     L   Source  
  Cetobacterium     L   Source  
  Chryseobacterium     H   Source  
  Cloacibacterium     L   Source  
  Clostridium     L   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Corynebacterium     H   Source  
  Cutibacterium     H   Source  
  Deinococcus     L   Source  
  Desulfovibrio     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dorea     H   Source  
  Dorea     H   Source  
  Eggerthella     H   Source  
  Emergencia     L   Source  
  Enterobacter     L   Source  
  Enterobacter     L   Source  
  Erysipelatoclostridium     L   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Eubacterium     H   Source  
  Faecalibacterium     H   Source  
  Flavobacterium     H   Source  
  Flavonifractor     H   Source  
  Fournierella     H   Source  
  Fretibacterium     H   Source  
  Fusobacterium     L   Source  
  Fusobacterium     L   Source  
  Gemella     L   Source  
  Granulicatella     L   Source  
  Holdemanella     L   Source  
  Holdemania     L   Source  
  Intestinibacter     H   Source  
  Klebsiella     L   Source  
  Lachnoanaerobaculum     H   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Lawsonella     H   Source  
  Leptotrichia     H   Source  
  Marvinbryantia     H   Source  
  Massilioclostridium     H   Source  
  Megamonas     H   Source  
  Megasphaera     L   Source  
  Merdibacter     H   Source  
  Microbacterium     H   Source  
  Mitsuokella     L   Source  
  Mogibacterium     H   Source  
  Neisseria     H   Source  
  Neisseria     H   Source  
  Odoribacter     L   Source  
  Olsenella     H   Source  
  Oribacterium     H   Source  
  Oscillibacter     H   Source  
  Oscillibacter     L   Source  
  Ottowia     H   Source  
  Oxalobacter     L   Source  
  Paenibacillus     H   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Paraprevotella     L   Source  
  Phascolarctobacterium     H   Source  
  Porphyromonas     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Prevotellamassilia     L   Source  
  Pseudomonas     L   Source  
  Pseudopropionibacterium     H   Source  
  Psychrobacillus     H   Source  
  Raoultella     L   Source  
  Romboutsia     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Rothia     H   Source  
  Rothia     H   Source  
  Rothia     H   Source  
  Ruminiclostridium     H   Source  
  Ruminococcus     L   Source  
  Ruminococcus     L   Source  
  Sellimonas     H   Source  
  Senegalimassilia     H   Source  
  Shigella     H   Source  
  Shigella     L   Source  
  Shuttleworthia     L   Source  
  Solobacterium     H   Source  
  Sphingobacterium     H   Source  
  Staphylococcus     L   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Subdoligranulum     H   Source  
  Sutterella     L   Source  
  Tannerella     H   Source  
  Varibaculum     H   Source  
  Veillonella     H   Source  
 order    Agaricales     L   Source  
  Flavobacteriales     L   Source  
  Opitutales     L   Source  
  Selenomonadales     L   Source  
 phylum    Actinobacteria     H   Source  
  Actinobacteria     H   Source  
  ascomycetes     H   Source  
  basidiomycetes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    [Bacteroides] pectinophilus     L   Source  
  [Clostridium] alkalicellulosi     H   Source  
  [Clostridium] citroniae     H   Source  
  [Clostridium] glycyrrhizinilyticum     H   Source  
  [Clostridium] hiranonis     L   Source  
  [Clostridium] methylpentosum     H   Source  
  [Clostridium] spiroforme     H   Source  
  [Clostridium] spiroforme     L   Source  
  [Clostridium] symbiosum     H   Source  
  [Eubacterium] eligens     L   Source  
  [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     L   Source  
  Abiotrophia adiacens     H   Source  
  Abiotrophia sp.     H   Source  
  Acetivibrio ethanolgignens     L   Source  
  Acidaminococcus intestini     H   Source  
  Acidaminococcus sp.     H   Source  
  Acidivorax temperans     L   Source  
  Acidovorax sp. 121606     L   Source  
  Acinetobacter genomosp. 5     L   Source  
  Acinetobacter soli     H   Source  
  Acinetobacter sp.     L   Source  
  ACM 3611     H   Source  
  Actinobacterium israeli     H   Source  
  Actinomyces cardiffensis     H   Source  
  Actinomyces dentalis     H   Source  
  Actinomyces eriksonii     L   Source  
  Actinomyces graevenitzii     H   Source  
  Actinomyces hongkongensis     H   Source  
  Actinomyces johnsonii     H   Source  
  Actinomyces massiliensis     H   Source  
  Actinomyces naeslundii     H   Source  
  Actinomyces naeslundii genospecies 2     H   Source  
  Actinomyces sp.     H   Source  
  Actinomyces timonensis     H   Source  
  Actinomyces turicensis     L   Source  
  Aerobacter aerogenes     H   Source  
  Aerococcus christensenii     L   Source  
  Aeromonas shigelloides     L   Source  
  Agathobaculum butyriciproducens     H   Source  
  Agrobacterium pusense     H   Source  
  Akkermansia muciniphila     L   Source  
  Akkermansia sp.     L   Source  
  Alistipes finegoldii     L   Source  
  Alistipes indistinctus     L   Source  
  Alistipes putredinis     L   Source  
  Alistipes shahii     L   Source  
  Alistipes sp.     H   Source  
  Alistipes timonensis     H   Source  
  Allisonella histaminiformans     H   Source  
  Allobaculum sp. Alo17     L   Source  
  Alloprevotella rava     H   Source  
  Anaerobacillus macyae (Santini et al. 2004) Zavarzina et al. 2009     H   Source  
  Anaerococcus sp.     L   Source  
  Anaerocolumna aminovalerica     L   Source  
  Anaeromassilibacillus sp.     H   Source  
  Anaerosporobacter mobilis     L   Source  
  Anaerostipes hadrus     L   Source  
  Anaerostipes sp.     H   Source  
  Anaerovibrio sp.     H   Source  
  ATCC 27780     H   Source  
  ATCC 35469     H   Source  
  ATCC 35539     L   Source  
  ATCC 43541     H   Source  
  ATCC 43838     L   Source  
  ATCC 43921     L   Source  
  ATCC 43994     L   Source  
  ATCC 49124     L   Source  
  ATCC 49918     L   Source  
  ATCC 51114     H   Source  
  ATCC 51147     H   Source  
  ATCC 51230     H   Source  
  ATCC 51502     H   Source  
  ATCC 51767     H   Source  
  ATCC 700285     L   Source  
  ATCC 700332     H   Source  
  ATCC 700666     L   Source  
  ATCC 700779     H   Source  
  ATCC 8043     L   Source  
  ATCC BAA-1200     H   Source  
  ATCC BAA-303     H   Source  
  Atopobium parvulum     H   Source  
  Atopobium rimae     H   Source  
  Aureobacterium sp.     H   Source  
  Bacillus amylolyticus Choukevitch 1911     H   Source  
  Bacillus fordii     L   Source  
  Bacillus okuhidaensis     H   Source  
  Bacillus pseudalcalophilus Nielsen et al. 1995     H   Source  
  Bacillus simplex     H   Source  
  Bacillus sp.     H   Source  
  Bacteroides barnesiae     L   Source  
  Bacteroides caecimuris     L   Source  
  Bacteroides cellulosilyticus     L   Source  
  Bacteroides clarus     L   Source  
  Bacteroides eggerthii     L   Source  
  Bacteroides faecichinchillae     L   Source  
  Bacteroides faecis     L   Source  
  Bacteroides finegoldii     L   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bacteroides graminisolvens     L   Source  
  Bacteroides intestinalis     L   Source  
  Bacteroides nordii     H   Source  
  Bacteroides nordii     L   Source  
  Bacteroides oleiciplenus     L   Source  
  Bacteroides pyogenes     L   Source  
  Bacteroides rodentium     L   Source  
  Bacteroides salyersiae     L   Source  
  Bacteroides sp.     L   Source  
  Bacteroides sp. AN 5745     L   Source  
  Bacteroides sp. JCM 17101     L   Source  
  Bacteroides thetaiotaomicron     L   Source  
  Bacteroides uniformis     L   Source  
  Bacteroides vulgatus     L   Source  
  Bacteroides xylanisolvens     L   Source  
  beta proteobacterium KSP3     L   Source  
  Bifidobacterium bifidum     L   Source  
  Bifidobacterium breve     L   Source  
  Bifidobacterium catenulatum     L   Source  
  Bifidobacterium longum     H   Source  
  Bifidobacterium pseudocatenulatum     H   Source  
  Bifidobacterium sp.     H   Source  
  Blautia producta     H   Source  
  Blautia sp.     H   Source  
  Blautia sp. Marseille-P2398     H   Source  
  Bradyrhizobium sp.     L   Source  
  Butyricicoccus pullicaecorum     H   Source  
  Butyricicoccus sp.     H   Source  
  Butyricimonas sp.     L   Source  
  Butyricimonas synergistica     L   Source  
  Butyricimonas virosa     L   Source  
  Butyrivibrio crossotus     L   Source  
  Butyrivibrio sp.     L   Source  
  Campylobacter curvus     L   Source  
  Candidatus Methanomethylophilus alvus Borrel et al. 2012     L   Source  
  Candidatus Prevotella conceptionensis Fenollar et al. 2006     H   Source  
  Capnocytophaga gingivalis     H   Source  
  Capnocytophaga leadbetteri     H   Source  
  Capnocytophaga sp.     H   Source  
  Capnocytophaga sputigena     H   Source  
  Caproiciproducens galactitolivorans     H   Source  
  Cardiobacterium sp.     H   Source  
  Catabacter hongkongensis     L   Source  
  Catonella morbi     H   Source  
  CCM 3540     L   Source  
  CCUG 353     H   Source  
  CCUG 41967     H   Source  
  CCUG 46150     L   Source  
  CCUG 556     H   Source  
  CCUG 57945     H   Source  
  CCUG 60371     H   Source  
  CECT 5975     H   Source  
  Cetobacterium sp.     L   Source  
  Chryseobacterium sp.     H   Source  
  CIP 110771     L   Source  
  Citrobacter sp.     L   Source  
  Cloacibacillus porcorum     L   Source  
  Cloacibacterium sp.     L   Source  
  Clostridium butyricum     L   Source  
  Clostridium perfringens     H   Source  
  Clostridium sp.     L   Source  
  Coccobacillus pfeifferi     L   Source  
  Collinsella aerofaciens     H   Source  
  Collinsella sp.     H   Source  
  Coprobacter sp.     L   Source  
  Coprococcus eutactus     L   Source  
  Coprococcus sp.     L   Source  
  Corynebacterium sp.     H   Source  
  Cutibacterium sp.     H   Source  
  Desulfovibrio desulfuricans     H   Source  
  Desulfovibrio desulfuricans     L   Source  
  Desulfovibrio piger     H   Source  
  Desulfovibrio sp.     L   Source  
  Dialister sp.     L   Source  
  Dolosigranulum pigrum     H   Source  
  Dorea sp.     H   Source  
  DSM 103034     H   Source  
  DSM 14437     H   Source  
  DSM 15606     H   Source  
  DSM 17055     H   Source  
  DSM 20284     H   Source  
  DSM 21459     L   Source  
  DSM 22759     L   Source  
  DSM 26109     L   Source  
  DSM 28989     L   Source  
  DSM 39     H   Source  
  DSM 3986     L   Source  
  DSM 4782     L   Source  
  DSM 7271     H   Source  
  Eggerthella lenta     H   Source  
  Eisenbergiella sp.     H   Source  
  Emergencia sp.     L   Source  
  Enterococcus asini     H   Source  
  Enterococcus faecalis     L   Source  
  Enterococcus gallinarum     H   Source  
  Enterococcus mundtii     L   Source  
  Escherichia citrophila (Asai et al. 1957) Asai et al. 1962     H   Source  
  Eubacterium limosum     L   Source  
  Eubacterium sp.     L   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     H   Source  
  Faecalibacterium sp.     L   Source  
  Faecalicoccus pleomorphus     H   Source  
  Faecalitalea cylindroides     H   Source  
  Flavibacterium sp.     H   Source  
  Flavonifractor plautii     H   Source  
  Flavonifractor plautii     H   Source  
  Flavonifractor sp.     H   Source  
  Fournierella sp.     H   Source  
  Fusobacterium mortiferum     L   Source  
  Fusobacterium sp.     L   Source  
  Gemmiger formicilis     H   Source  
  Granulicatella elegans     H   Source  
  Granulicatella sp.     H   Source  
  Holdemanella sp.     L   Source  
  Holdemania sp.     L   Source  
  Intestinibacter bartlettii     L   Source  
  Intestinimonas butyriciproducens     L   Source  
  JCM 1093     L   Source  
  JCM 8722     H   Source  
  Kingella denitrificans     H   Source  
  Klebsiella pneumoniae aerogenes     L   Source  
  Kluyvera ascorbata     L   Source  
  Kluyvera georgiana     L   Source  
  Kytococcus sedentarius     H   Source  
  Lachnoanaerobaculum sp.     H   Source  
  Lachnoanaerobaculum umeaense     H   Source  
  Lachnospira sp.     L   Source  
  Lactobacillus curvatus     H   Source  
  Lactobacillus fermentum     L   Source  
  Lactobacillus murinus     L   Source  
  Lactobacillus sakei     H   Source  
  Lactobacillus salivarius     L   Source  
  Lactococcus lactis     L   Source  
  Lautropia mirabilis     H   Source  
  Leadbetterella byssophila     L   Source  
  Leclercia adecarboxylata     L   Source  
  Leptotrichia sp.     H   Source  
  Leuconostoc lactis     L   Source  
  Leuconostoc mesenteroides     H   Source  
  LMG:5290     H   Source  
  LMG:5313     L   Source  
  LMG:9496     H   Source  
  Marvinbryantia sp.     H   Source  
  Massilimicrobiota timonensis Tall et al.     H   Source  
  Massilioclostridium sp.     H   Source  
  Megasphaera micronuciformis     L   Source  
  Methanobrevibacter sp.     L   Source  
  Mitsuokella sp.     L   Source  
  Mogibacterium sp.     H   Source  
  Mycoplasma hominis     L   Source  
  Negativicoccus massiliensis Togo et al. 2016     H   Source  
  Neisseria cinerea     H   Source  
  Neisseria flavescens     H   Source  
  Neisseria meningitidis     H   Source  
  Neisseria sp.     H   Source  
  Odoribacter sp.     L   Source  
  Odoribacter splanchnicus     L   Source  
  Olsenella profusa     H   Source  
  Olsenella sp.     H   Source  
  Olsenella uli     H   Source  
  Oribacterium sp.     H   Source  
  Oscillibacter sp.     L   Source  
  Ottowia sp.     H   Source  
  Oxalobacter formigenes     L   Source  
  Oxalobacter sp.     L   Source  
  Paenibacillus sp.     H   Source  
  Parabacteroides distasonis     H   Source  
  Parabacteroides distasonis     L   Source  
  Parabacteroides goldsteinii     L   Source  
  Parabacteroides gordonii     L   Source  
  Parabacteroides johnsonii     L   Source  
  Parabacteroides sp.     L   Source  
  Paraprevotella sp.     H   Source  
  Paraprevotella xylaniphila     H   Source  
  Parasutterella sp.     L   Source  
  Peptococcus niger     H   Source  
  Peptoniphilus sp.     H   Source  
  Phascolarctobacterium faecium     L   Source  
  Phascolarctobacterium sp.     L   Source  
  Porphyromonas catoniae     H   Source  
  Porphyromonas endodontalis     L   Source  
  Porphyromonas somerae     H   Source  
  Porphyromonas sp.     H   Source  
  Prevotella aurantiaca     H   Source  
  Prevotella buccae     L   Source  
  Prevotella buccalis     H   Source  
  Prevotella copri     H   Source  
  Prevotella histicola     H   Source  
  Prevotella loescheii     H   Source  
  Prevotella maculosa     H   Source  
  Prevotella melaninogenica     H   Source  
  Prevotella melaninogenica     H   Source  
  Prevotella micans     H   Source  
  Prevotella multisaccharivorax     H   Source  
  Prevotella nanceiensis     H   Source  
  Prevotella nigrescens     H   Source  
  Prevotella oralis     L   Source  
  Prevotella oulorum     H   Source  
  Prevotella pallens     H   Source  
  Prevotella shahii     H   Source  
  Prevotella sp.     L   Source  
  Prevotella veroralis     L   Source  
  Pseudoflavonifractor sp.     H   Source  
  Pseudomonas putida     H   Source  
  Pseudopedobacter saltans     H   Source  
  Pseudopropionibacterium sp.     H   Source  
  Pseudoramibacter alactolyticus     H   Source  
  Psychrobacillus sp.     H   Source  
  Pyramidobacter sp.     L   Source  
  Raoultella sp.     L   Source  
  Rikenella microfusus     L   Source  
  Romboutsia sp.     L   Source  
  Roseburia hominis     L   Source  
  Roseburia inulinivorans     L   Source  
  Roseburia sp.     L   Source  
  Rothia aeria     H   Source  
  Rothia dentocariosa     H   Source  
  Rothia mucilaginosa     H   Source  
  Rothia sp.     H   Source  
  Ruminiclostridium sp.     L   Source  
  Ruminococcaceae bacterium D16     L   Source  
  Ruminococcus gauvreauii     H   Source  
  Ruminococcus sp.     L   Source  
  Sanguibacteroides justesenii Sydenham et al. 2015     L   Source  
  Scardovia inopinata     H   Source  
  Scardovia wiggsiae     H   Source  
  Selenomonas artemidis     H   Source  
  Selenomonas sputigena     L   Source  
  Slackia exigua     H   Source  
  Slackia sp.     H   Source  
  Sneathia sanguinegens     L   Source  
  Sphingobacterium sp.     H   Source  
  Staphylococcus aureus     L   Source  
  Staphylococcus capitis     L   Source  
  Staphylococcus xylosus     L   Source  
  Stomatobaculum longum     H   Source  
  Streptococcus cristatus     H   Source  
  Streptococcus G418     H   Source  
  Streptococcus mitis     H   Source  
  Streptococcus oralis     H   Source  
  Streptococcus oralis     H   Source  
  Streptococcus parauberis     L   Source  
  Streptococcus pneumoniae     H   Source  
  Streptococcus sanguinis     L   Source  
  Streptococcus sobrinus     L   Source  
  Streptococcus thermophilus     L   Source  
  Subdoligranulum sp.     H   Source  
  Subdoligranulum variabile     L   Source  
  Sutterella sp.     L   Source  
  Sutterella wadsworthensis     L   Source  
  Tannerella sp.     H   Source  
  Terrisporobacter sp.     L   Source  
  Tyzzerella sp.     L   Source  
  Varibaculum sp.     H   Source  
  Veillonella rogosae     H   Source  
  Veillonella sp.     L   Source  
  VPI 5424     H   Source  
  VPI 8617     H   Source  
  Wolinella recta     H   Source  
Asthma   family    Enterobacteriaceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Akkermansia     L   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
 no rank    Haemophilus influenzae 10810     L   Source  
 phylum    Proteobacteria     H   Source  
 species    Bacteroides stercoris     L   Source  
  Coccobacillus pfeifferi     L   Source  
  Eggerthella lenta     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Staphylococcus aureus     L   Source  
  Sutterella wadsworthensis     L   Source  
Atherosclerosis   class    Bacilli     H   Source  
  Clostridia     H   Source  
  Kiritimatiellae     L   Source  
 family    Acidaminococcaceae     L   Source  
  Bacteroidaceae     H   Source  
  Barnesiellaceae     L   Source  
  Candidatus Homeothermaceae     L   Source  
  Clostridiaceae     L   Source  
  Dermabacteraceae     H   Source  
  Eggerthellaceae     H   Source  
  Elusimicrobiaceae     L   Source  
  Enterobacteriaceae     H   Source  
  Erysipelotrichaceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     H   Source  
  Oscillospiraceae     H   Source  
  Paludibacteraceae     L   Source  
  Rikenellaceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     H   Source  
  Tannerellaceae Ormerod et al. 2016     L   Source  
 genus    Abiotrophia     L   Source  
  Acidipropionibacterium     H   Source  
  Actinomyces     H   Source  
  Agathobacter     L   Source  
  Akkermansia     H   Source  
  Akkermansia     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Alloscardovia     L   Source  
  Anaerococcus     H   Source  
  Anaeroglobus     L   Source  
  Anaerostipes     H   Source  
  Anaerotruncus     L   Source  
  Atopobium     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Bilophila     L   Source  
  Blautia     H   Source  
  Butyricicoccus     H   Source  
  Campylobacter     H   Source  
  Candidatus Homeothermus     L   Source  
  Candidatus Stoquefichus     H   Source  
  Capnocytophaga     H   Source  
  Cardiobacterium     H   Source  
  Chryseobacterium     L   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Coprobacillus     H   Source  
  Coprobacter     L   Source  
  Coprococcus     H   Source  
  Corynebacterium     H   Source  
  Criibacterium     H   Source  
  Cryptobacterium     H   Source  
  Cutibacterium     H   Source  
  Desulfovibrio     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dorea     H   Source  
  Dysgonomonas     L   Source  
  Edwardsiella     H   Source  
  Eggerthella     H   Source  
  Eggerthia     L   Source  
  Emergencia     H   Source  
  Enterobacter     H   Source  
  Enterococcus     L   Source  
  Erysipelatoclostridium     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Eubacterium     H   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Finegoldia     L   Source  
  Fournierella     H   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Gemella     H   Source  
  Gordonibacter     L   Source  
  Granulicatella     H   Source  
  Haemophilus     L   Source  
  Holdemanella     H   Source  
  Holdemania     H   Source  
  Intestinibacter     H   Source  
  Johnsonella     H   Source  
  Klebsiella     H   Source  
  Lachnoanaerobaculum     H   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Lactobacillus     H   Source  
  Lactosphaera     H   Source  
  Leptotrichia     H   Source  
  Leucobacter     H   Source  
  Levyella     H   Source  
  Megasphaera     H   Source  
  Merdibacter     H   Source  
  Methanobrevibacter     L   Source  
  Mogibacterium     H   Source  
  Neglecta     L   Source  
  Olsenella     H   Source  
  Oribacterium     H   Source  
  Oscillibacter     L   Source  
  Oxalobacter     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Paraprevotella     L   Source  
  Parascardovia     L   Source  
  Parvimonas     H   Source  
  Pediococcus     L   Source  
  Peptoniphilus     H   Source  
  Peptostreptococcus     H   Source  
  Phascolarctobacterium     L   Source  
  Porphyromonas     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Prevotellamassilia     L   Source  
  Propionibacterium     H   Source  
  Proteus     H   Source  
  Providencia     H   Source  
  Pseudoflavonifractor     L   Source  
  Pseudopropionibacterium     H   Source  
  Raoultella     H   Source  
  Romboutsia     H   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Rothia     H   Source  
  Rothia     H   Source  
  Ruminiclostridium     H   Source  
  Ruminococcus     H   Source  
  Ruthenibacterium     H   Source  
  Scardovia     L   Source  
  Sellimonas     H   Source  
  Siccibacter     H   Source  
  Slackia     L   Source  
  Solobacterium     H   Source  
  Stomatobaculum     L   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Subdoligranulum     L   Source  
  Succinatimonas     L   Source  
  Succinivibrio     L   Source  
  Sutterella     L   Source  
  Tyzzerella     H   Source  
  Varibaculum     H   Source  
  Veillonella     H   Source  
  Weissella     L   Source  
 order    Bacteroidales     L   Source  
  Flavobacteriales     L   Source  
  Opitutales     L   Source  
 species    [Bacteroides] coagulans     H   Source  
  [Bacteroides] pectinophilus     L   Source  
  [Clostridium] bolteae     H   Source  
  [Clostridium] cocleatum     H   Source  
  [Clostridium] glycyrrhizinilyticum     H   Source  
  [Clostridium] hiranonis     H   Source  
  [Clostridium] innocuum     H   Source  
  [Clostridium] methylpentosum     H   Source  
  [Clostridium] scindens     H   Source  
  [Clostridium] spiroforme     H   Source  
  [Eubacterium] brachy     L   Source  
  [Eubacterium] eligens     L   Source  
  [Eubacterium] infirmum     L   Source  
  [Eubacterium] saphenum     L   Source  
  [Hallella] seregens     L   Source  
  [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     H   Source  
  Abiotrophia adiacens     H   Source  
  Abiotrophia defectiva     L   Source  
  Acidaminococcus intestini     H   Source  
  ACM 3611     H   Source  
  Actinobacterium israeli     H   Source  
  Actinomyces cardiffensis     H   Source  
  Actinomyces dentalis     H   Source  
  Actinomyces eriksonii     L   Source  
  Actinomyces graevenitzii     H   Source  
  Actinomyces hongkongensis     H   Source  
  Actinomyces johnsonii     H   Source  
  Actinomyces massiliensis     H   Source  
  Actinomyces naeslundii     H   Source  
  Actinomyces naeslundii genospecies 2     H   Source  
  Actinomyces radicidentis     H   Source  
  Actinomyces sp.     H   Source  
  Actinomyces timonensis     H   Source  
  Actinomyces viscosus     L   Source  
  Aerobacter aerogenes     H   Source  
  Aeromonas shigelloides     H   Source  
  Akkermansia muciniphila     H   Source  
  Akkermansia sp.     L   Source  
  Alistipes sp.     H   Source  
  Alistipes timonensis     L   Source  
  Alloprevotella rava     L   Source  
  Alloscardovia omnicolens     L   Source  
  Anaerococcus octavius     H   Source  
  Anaerococcus prevotii     H   Source  
  Anaerococcus sp.     H   Source  
  Anaeroglobus geminatus     H   Source  
  Anaerostipes caccae     H   Source  
  Anaerostipes sp.     H   Source  
  AS 1.2280     H   Source  
  ATCC 13146 [[Leuconostoc amelibiosum Schillinger et al. 1989]]     H   Source  
  ATCC 25258     H   Source  
  ATCC 27570     H   Source  
  ATCC 29062     H   Source  
  ATCC 33028     H   Source  
  ATCC 33072     H   Source  
  ATCC 33199     H   Source  
  ATCC 33241     H   Source  
  ATCC 33257     H   Source  
  ATCC 33313     H   Source  
  ATCC 35313 [[Koserella trabulsii Hickman-Brenner et al. 1985]]     H   Source  
  ATCC 35469     H   Source  
  ATCC 49062     H   Source  
  ATCC 49124     H   Source  
  ATCC 49372     H   Source  
  ATCC 49427     H   Source  
  ATCC 51266     H   Source  
  ATCC 51523     H   Source  
  ATCC 51767     H   Source  
  ATCC 700542     H   Source  
  ATCC 700632     H   Source  
  ATCC 700779     H   Source  
  ATCC 700780     H   Source  
  ATCC 700907     H   Source  
  ATCC BAA-102     L   Source  
  ATCC BAA-303     H   Source  
  ATCC BAA-960     H   Source  
  Atlantibacter subterranea (Shelobolina et al. 2005) Hata et al. 2016     H   Source  
  Atopobium parvulum     H   Source  
  Atopobium rimae     H   Source  
  Atopobium sp.     H   Source  
  Bacillus megaterium     H   Source  
  Bacteroides barnesiae     L   Source  
  Bacteroides caecimuris     L   Source  
  Bacteroides cellulosilyticus     L   Source  
  Bacteroides coprophilus     L   Source  
  Bacteroides fluxus     H   Source  
  Bacteroides fragilis     L   Source  
  Bacteroides gallinarum     L   Source  
  Bacteroides graminisolvens     L   Source  
  Bacteroides helcogenes     L   Source  
  Bacteroides intestinalis     L   Source  
  Bacteroides massiliensis     L   Source  
  Bacteroides mediterraneensis Mailhe et al. 2016     L   Source  
  Bacteroides ovatus     L   Source  
  Bacteroides paurosaccharolyticus     L   Source  
  Bacteroides pyogenes     L   Source  
  Bacteroides reticulotermitis     H   Source  
  Bacteroides rodentium     H   Source  
  Bacteroides salanitronis     H   Source  
  Bacteroides sp.     L   Source  
  Bacteroides sp. S427     H   Source  
  Bacteroides stercoris     L   Source  
  Bacteroides thetaiotaomicron     L   Source  
  Bacteroides uniformis     L   Source  
  Bacteroides vulgatus     L   Source  
  Bacteroides xylanisolvens     L   Source  
  Bifidobacterium pseudocatenulatum     L   Source  
  Bifidobacterium pseudolongum     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Bifidobacterium sp.     L   Source  
  Bilophila wadsworthia     L   Source  
  Blautia producta     L   Source  
  Blautia sp.     H   Source  
  Bulleidia extructa     H   Source  
  Butyricicoccus sp.     H   Source  
  Butyricimonas sp.     L   Source  
  Campylobacter sp.     H   Source  
  Capnocytophaga gingivalis     H   Source  
  Capnocytophaga sp.     H   Source  
  Cardiobacterium sp.     H   Source  
  CAV     L   Source  
  CCM 7299     H   Source  
  CCUG 41967     H   Source  
  CCUG 45998 A     H   Source  
  CCUG 46149     H   Source  
  CCUG 48363     H   Source  
  CCUG 48456     H   Source  
  CCUG 48459     H   Source  
  CCUG 48460     H   Source  
  CCUG 64422     L   Source  
  CECT 5975     H   Source  
  Chryseobacterium sp.     L   Source  
  CIP 106922     H   Source  
  CIP 110771     H   Source  
  CIPP II     H   Source  
  Citrobacter sp.     H   Source  
  Clostridioides difficile     H   Source  
  Clostridium butyricum     H   Source  
  Clostridium clostridioforme     H   Source  
  Clostridium perfringens     L   Source  
  Clostridium sp.     H   Source  
  Coccobacillus pfeifferi     L   Source  
  Collinsella intestinalis     L   Source  
  Collinsella sp.     H   Source  
  Coprobacter sp.     L   Source  
  Coprococcus sp.     H   Source  
  Corynebacterium durum     L   Source  
  Corynebacterium sp.     H   Source  
  CRBIP 24.179     H   Source  
  Cryptobacterium curtum     L   Source  
  Cutibacterium sp.     H   Source  
  Desulfovibrio piger     L   Source  
  Dialister invisus     L   Source  
  Dialister sp.     L   Source  
  Dorea sp.     H   Source  
  DSM 103034     L   Source  
  DSM 15606     H   Source  
  DSM 17055     H   Source  
  DSM 19284     H   Source  
  DSM 20284     H   Source  
  DSM 22761     H   Source  
  DSM 26109     L   Source  
  DSM 28989     H   Source  
  DSM 3986     H   Source  
  DSM 7271     H   Source  
  Dysgonomonas capnocytophagoides     H   Source  
  Dysgonomonas sp.     L   Source  
  Effusibacillus pohliae     H   Source  
  Eggerthella lenta     H   Source  
  Eggerthella sp.     H   Source  
  Eggerthia catenaformis     H   Source  
  Eisenbergiella sp.     L   Source  
  Eisenbergiella tayi     H   Source  
  Emergencia sp.     H   Source  
  Enorma massiliensis     H   Source  
  Enterobacter hormaechei     H   Source  
  Enterobacter oryzaendophyticus     H   Source  
  Enterobacter sp.     H   Source  
  Enterococcus cecorum     H   Source  
  Enterococcus faecalis     H   Source  
  Enterococcus faecium     H   Source  
  Enterococcus gallinarum     H   Source  
  Erysipelatoclostridium ramosum     H   Source  
  Escherichia sp.     H   Source  
  Escherichia/Shigella albertii     L   Source  
  Eubacterium limosum     L   Source  
  Eubacterium oxidoreducens     H   Source  
  Eubacterium sp.     H   Source  
  Eubacterium uniforme     H   Source  
  Faecalibacterium sp.     L   Source  
  Faecalitalea cylindroides     H   Source  
  Finegoldia magna     H   Source  
  Flavonifractor sp.     H   Source  
  Fournierella sp.     H   Source  
  Fusobacterium nucleatum     L   Source  
  Fusobacterium sp.     H   Source  
  Fusobacterium varium     L   Source  
  Gardnerella vaginalis     H   Source  
  Gemella sp.     H   Source  
  Gordonibacter pamelaeae     H   Source  
  Gordonibacter sp.     H   Source  
  Gordonibacter urolithinfaciens     H   Source  
  Granulicatella elegans     H   Source  
  Granulicatella sp.     H   Source  
  Haemophilus paraphrohaemolyticus     L   Source  
  Hafnia alvei     H   Source  
  Holdemanella sp.     H   Source  
  Holdemania sp.     H   Source  
  Hungatella hathewayi     H   Source  
  Intestinimonas butyriciproducens     L   Source  
  JCM 1039     H   Source  
  JCM 1093     H   Source  
  JCM 5829     H   Source  
  JCM 5830     L   Source  
  JCM 8722     H   Source  
  JCM 8725     H   Source  
  Klebsiella ornithinolytica     H   Source  
  Klebsiella pneumoniae aerogenes     H   Source  
  Klebsiella sp.     H   Source  
  Kluyvera ascorbata     L   Source  
  Kytococcus sedentarius     H   Source  
  Lachnoanaerobaculum sp.     H   Source  
  Lachnoanaerobaculum umeaense     H   Source  
  Lachnospira sp.     L   Source  
  Lactobacillus acidophilus     H   Source  
  Lactobacillus agilis     H   Source  
  Lactobacillus curvatus     H   Source  
  Lactobacillus delbrueckii     H   Source  
  Lactobacillus equi     H   Source  
  Lactobacillus fermentum     H   Source  
  Lactobacillus gasseri     H   Source  
  Lactobacillus intestinalis     H   Source  
  Lactobacillus johnsonii     H   Source  
  Lactobacillus mucosae     H   Source  
  Lactobacillus paracasei     H   Source  
  Lactobacillus plantarum     H   Source  
  Lactobacillus reuteri     H   Source  
  Lactobacillus salivarius     H   Source  
  Lactobacillus sp.     H   Source  
  Lactobacillus vaginalis     H   Source  
  Lactococcus lactis     H   Source  
  Lactococcus sp.     H   Source  
  Lactonifactor longoviformis     H   Source  
  Leadbetterella byssophila     L   Source  
  Leptotrichia sp.     H   Source  
  Leucobacter sp.     H   Source  
  Leuconostoc lactis     H   Source  
  LMG:18984     H   Source  
  LMG:7944     L   Source  
  LMG:9496     H   Source  
  Megamonas hypermegale     L   Source  
  Megasphaera micronuciformis     H   Source  
  Megasphaera sp.     H   Source  
  Methanobrevibacter smithii     H   Source  
  Methanobrevibacter sp.     H   Source  
  Methanomassiliicoccus luminyensis     L   Source  
  Methanosphaera cuniculi     H   Source  
  Micromonas sp. (in: Bacteria)     H   Source  
  Mitsuokella jalaludinii     L   Source  
  Mogibacterium sp.     H   Source  
  Moraxella osloensis     L   Source  
  Morganella morganii     H   Source  
  MUTK 20     H   Source  
  NCTC 5224     H   Source  
  Negativicoccus succinicivorans     H   Source  
  Neglecta sp.     L   Source  
  Odoribacter laneus     H   Source  
  Odoribacter sp.     H   Source  
  Olsenella profusa     H   Source  
  Olsenella sp.     H   Source  
  Olsenella uli     H   Source  
  Oribacterium sinus     L   Source  
  Oribacterium sp.     H   Source  
  Oscillibacter sp.     L   Source  
  Oxalobacter formigenes     L   Source  
  Paeniclostridium sordellii     H   Source  
  Parabacteroides chinchillae     L   Source  
  Parabacteroides distasonis     L   Source  
  Parabacteroides sp.     L   Source  
  Paraclostridium bifermentans     H   Source  
  Paraprevotella sp.     H   Source  
  Parasutterella sp.     L   Source  
  Parvimonas micra     H   Source  
  PCU:282     H   Source  
  Pediococcus pentosaceus     H   Source  
  Peptoniphilus rhinitidis Kim et al. 2012     H   Source  
  Peptoniphilus sp.     H   Source  
  Peptostreptococcus anaerobius     L   Source  
  Peptostreptococcus sp.     H   Source  
  Peptostreptococcus stomatis     H   Source  
  Phascolarctobacterium faecium     H   Source  
  Phascolarctobacterium sp.     L   Source  
  Porphyromonas cangingivalis     L   Source  
  Porphyromonas catoniae     L   Source  
  Porphyromonas endodontalis     L   Source  
  Porphyromonas somerae     H   Source  
  Porphyromonas sp.     L   Source  
  Porphyromonas uenonis     H   Source  
  Prevotella albensis     L   Source  
  Prevotella amnii     L   Source  
  Prevotella baroniae     L   Source  
  Prevotella bergensis     L   Source  
  Prevotella bivia     H   Source  
  Prevotella colorans     H   Source  
  Prevotella copri     L   Source  
  Prevotella denticola     L   Source  
  Prevotella maculosa     L   Source  
  Prevotella marshii     L   Source  
  Prevotella micans     L   Source  
  Prevotella nigrescens     H   Source  
  Prevotella oralis     L   Source  
  Prevotella oris     H   Source  
  Prevotella paludivivens     L   Source  
  Prevotella pleuritidis     H   Source  
  Prevotella saccharolytica     L   Source  
  Prevotella sp.     L   Source  
  Prevotella stercorea     L   Source  
  Prevotella timonensis     H   Source  
  Propionibacterium sp.     H   Source  
  Pseudoflavonifractor capillosus     L   Source  
  Pseudopropionibacterium sp.     H   Source  
  Pseudoramibacter alactolyticus     H   Source  
  Pyramidobacter piscolens     H   Source  
  Raoultella sp.     H   Source  
  Rikenella microfusus     H   Source  
  Romboutsia sp.     H   Source  
  Roseburia faecis     L   Source  
  Roseburia intestinalis     L   Source  
  Roseburia inulinivorans     L   Source  
  Roseburia sp.     H   Source  
  Rothia aeria     H   Source  
  Rothia dentocariosa     H   Source  
  Rothia mucilaginosa     H   Source  
  Rothia sp.     H   Source  
  Ruminiclostridium sp.     H   Source  
  Ruminococcus albus     L   Source  
  Ruminococcus bromii     H   Source  
  Ruminococcus sp.     H   Source  
  Scardovia inopinata     H   Source  
  Scardovia wiggsiae     H   Source  
  Shuttleworthia satelles     H   Source  
  Siccibacter sp.     H   Source  
  Slackia exigua     H   Source  
  Solobacterium moorei     H   Source  
  Staphylococcus capitis     H   Source  
  Staphylococcus epidermidis albus     H   Source  
  Staphylococcus pasteuri     H   Source  
  Stomatobaculum longum     H   Source  
  Streptococcus anginosus     H   Source  
  Streptococcus australis     H   Source  
  Streptococcus constellatus     H   Source  
  Streptococcus cristatus     H   Source  
  Streptococcus G418     H   Source  
  Streptococcus gordonii     H   Source  
  Streptococcus intermedius     H   Source  
  Streptococcus massiliensis     H   Source  
  Streptococcus mitis     H   Source  
  Streptococcus mutans     L   Source  
  Streptococcus oralis     H   Source  
  Streptococcus oralis     H   Source  
  Streptococcus pneumoniae     H   Source  
  Streptococcus salivarius     H   Source  
  Streptococcus sanguinis     H   Source  
  Streptococcus thermophilus     H   Source  
  Streptomyces cattleya     H   Source  
  Subdoligranulum sp.     L   Source  
  Succinatimonas hippei     L   Source  
  Succinivibrio sp.     L   Source  
  Sutterella sp.     L   Source  
  Trichococcus sp.     H   Source  
  Tyzzerella nexilis     H   Source  
  Tyzzerella sp.     H   Source  
  Varibaculum sp.     H   Source  
  Veillonella atypica     H   Source  
  Veillonella dispar     H   Source  
  Veillonella parvula     H   Source  
  Veillonella sp.     H   Source  
  VPI 5424     H   Source  
  VPI 8617     H   Source  
  Wolinella recta     H   Source  
 strain    'Streptococcus oralis subsp. tigurinus'     H   Source  
Autism   class    Alphaproteobacteria     H   Source  
 family    Enterobacteriaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     L   Source  
  Eubacteriaceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Sutterellaceae     H   Source  
  Veillonellaceae     L   Source  
 genus    Akkermansia     H   Source  
  Akkermansia     L   Source  
  Alistipes     L   Source  
  Alistipes     L   Source  
  Anaerotruncus     L   Source  
  Bacteroides     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bilophila     L   Source  
  Bilophila     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Butyricimonas     H   Source  
  Caloramator     H   Source  
  Candida     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Clostridium     L   Source  
  Clostridium     L   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Coprococcus     H   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Corynebacterium     H   Source  
  Corynebacterium     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dorea     H   Source  
  Dorea     L   Source  
  Eubacterium     L   Source  
  Faecalibacterium     H   Source  
  Lactobacillus     H   Source  
  Lactobacillus     H   Source  
  Lactobacillus     H   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Odoribacter     H   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Ruminococcus     H   Source  
  Ruminococcus     L   Source  
  Sarcina     H   Source  
  Sarcina     H   Source  
  Staphylococcus     H   Source  
  Streptococcus     L   Source  
  Sutterella     H   Source  
  Sutterella     H   Source  
  Sutterella     L   Source  
  Turicibacter     L   Source  
  Veillonella     L   Source  
  Veillonella     L   Source  
  Veillonella     L   Source  
 phylum    Bacteroidetes     H   Source  
  Bacteroidetes     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
 species    [Eubacterium] siraeum     L   Source  
  [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     H   Source  
  Akkermansia muciniphila     H   Source  
  Akkermansia muciniphila     L   Source  
  Anaerostipes caccae     H   Source  
  Bacteroides sp.     L   Source  
  Bacteroides vulgatus     H   Source  
  Candida     H   Source  
Autoimmune Disease   species    Porphyromonas gingivalis     H   Source  
Barrett esophagus cancer   family    Actinomycetaceae     L   Source  
  Campylobacteraceae     L   Source  
  Carnobacteriaceae     L   Source  
  Coriobacteriaceae     H   Source  
  Erysipelotrichaceae     L   Source  
  Veillonellaceae     L   Source  
 genus    Actinomyces     L   Source  
  Campylobacter     L   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Granulicatella     L   Source  
  Megasphaera     L   Source  
  Solobacterium     L   Source  
  Streptococcus     L   Source  
  Veillonella     H   Source  
 phylum    Proteobacteria     H   Source  
 species    Lactobacillus fermentum     H   Source  
Brain Trauma   family    Bifidobacteriaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     H   Source  
  Peptococcaceae     H   Source  
  Prevotellaceae     L   Source  
 genus    Bacteroides     L   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Enterobacter     H   Source  
  Eubacterium     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Megasphaera     H   Source  
  Oscillibacter     H   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Turicibacter     L   Source  
 order    Anaeroplasmatales     L   Source  
  Bacteroidales     L   Source  
  Clostridiales     H   Source  
  Lactobacillales     L   Source  
 species    Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
Celiac Disease   family    Enterobacteriaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     L   Source  
  Staphylococcaceae     H   Source  
  Streptococcaceae     L   Source  
 genus    Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Novispirillum     H   Source  
  Staphylococcus     H   Source  
 phylum    Firmicutes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    Bacteroides vulgatus     H   Source  
  Bifidobacterium bifidum     H   Source  
  Bifidobacterium longum     L   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
Chronic Fatigue Syndrome   family    Clostridiaceae     H   Source  
  Porphyromonadaceae     L   Source  
  Pseudomonadaceae     H   Source  
 genus    Alistipes     H   Source  
  Atopostipes     H   Source  
  Bacteroides     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Coprobacillus     H   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Dorea     L   Source  
  Eggerthella     H   Source  
  Enterobacter     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Enterococcus     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Haemophilus     L   Source  
  Klebsiella     H   Source  
  Lactobacillus     B   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Leptotrichia     H   Source  
  Porphyromonas     L   Source  
  Pseudomonas     H   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Streptococcus     L   Source  
  Turicibacter     H   Source  
  Veillonella     L   Source  
 order    Pseudomonadales     H   Source  
 phylum    Fusobacteraeota     H   Source  
 species    [Clostridium] bolteae     H   Source  
  [Clostridium] scindens     H   Source  
  [Clostridium] symbiosum     H   Source  
  [Eubacterium] hallii     L   Source  
  [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  Anaerostipes caccae     H   Source  
  Bacteroides vulgatus     L   Source  
  Blautia obeum     L   Source  
  Clostridiales bacterium 1_7_47FAA     H   Source  
  Clostridiales bacterium L2-14     H   Source  
  Clostridium butyricum     L   Source  
  Coprococcus catus     L   Source  
  Coprococcus comes     L   Source  
  Dorea formicigenerans     L   Source  
  Dorea longicatena     L   Source  
  Eggerthella lenta     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Haemophilus parainfluenzae     L   Source  
  Odoribacter splanchnicus     L   Source  
  Parabacteroides distasonis     L   Source  
  Parabacteroides merdae     L   Source  
  Prevotella histicola     L   Source  
  Pseudoflavonifractor capillosus     H   Source  
  Roseburia inulinivorans     L   Source  
  Vibrio jejuni     H   Source  
Chronic Kidney Disease   family    Lachnospiraceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Bacteroides     H   Source  
  Butyricicoccus     L   Source  
  Carnobacterium     L   Source  
  Collinsella     L   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Dielma     H   Source  
  Eggerthella     H   Source  
  Erysipelatoclostridium     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Flavonifractor     H   Source  
  Holdemanella     H   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Megamonas     H   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Romboutsia     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Ruminiclostridium     H   Source  
  Scardovia     H   Source  
  Shigella     H   Source  
  Subdoligranulum     L   Source  
  Tyzzerella     L   Source  
  Weissella     H   Source  
 phylum    Bacteroidetes     H   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    [Clostridium] innocuum     H   Source  
  [Eubacterium] rectale     L   Source  
  [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     H   Source  
  Brucella tularensis     L   Source  
Colorectal Cancer   class    Bacilli     H   Source  
  Clostridia     H   Source  
 family    Acidaminococcaceae     L   Source  
  Atopobiaceae     H   Source  
  Bacteroidaceae     L   Source  
  Barnesiellaceae     H   Source  
  Candidatus Homeothermaceae     L   Source  
  Christensenellaceae     H   Source  
  Clostridiaceae     H   Source  
  Desulfobulbaceae     H   Source  
  Desulfovibrionaceae     H   Source  
  Eggerthellaceae     H   Source  
  Erysipelotrichaceae     L   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Oscillospiraceae     H   Source  
  Paludibacteraceae     H   Source  
  Peptococcaceae     H   Source  
  Rikenellaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     H   Source  
 genus    Abiotrophia     L   Source  
  Acidaminococcus     L   Source  
  Actinomyces     L   Source  
  Agathobacter     L   Source  
  Agromonas     L   Source  
  Akkermansia     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Anaerococcus     L   Source  
  Anaerostipes     L   Source  
  Anaerotruncus     H   Source  
  Angelakisella     H   Source  
  Bacteroides     H   Source  
  Barnesiella     H   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Bilophila     H   Source  
  Blautia     H   Source  
  Butyricicoccus     L   Source  
  Campylobacter     H   Source  
  Candidatus Homeothermus     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Collinsella     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Dialister     H   Source  
  Dorea     H   Source  
  Enterococcus     L   Source  
  Erysipelatoclostridium     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Eubacterium     H   Source  
  Faecalibacterium     H   Source  
  Faecalicoccus     H   Source  
  Flavonifractor     H   Source  
  Fournierella     H   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Gemella     H   Source  
  Gemella     H   Source  
  Haemophilus     H   Source  
  Intestinimonas     L   Source  
  Klebsiella     L   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Leptotrichia     H   Source  
  Leptotrichia     L   Source  
  Libanicoccus     H   Source  
  Megasphaera     L   Source  
  Merdibacter     H   Source  
  Methanobrevibacter     H   Source  
  Mogibacterium     H   Source  
  Neglecta     H   Source  
  Odoribacter     H   Source  
  Oscillibacter     H   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Parvimonas     H   Source  
  Parvimonas     H   Source  
  Peptostreptococcus     H   Source  
  Peptostreptococcus     H   Source  
  Phocea     H   Source  
  Porphyromonas     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotellamassilia     H   Source  
  Pseudoflavonifractor     H   Source  
  Pseudomonas     L   Source  
  Pseudoramibacter     H   Source  
  Rothia     L   Source  
  Rothia     L   Source  
  Ruminiclostridium     H   Source  
  Ruminococcus     H   Source  
  Ruthenibacterium     H   Source  
  Sellimonas     L   Source  
  Shigella     L   Source  
  Shuttleworthia     H   Source  
  Stomatobaculum     H   Source  
  Streptococcus     H   Source  
  Subdoligranulum     H   Source  
  Succiniclasticum     H   Source  
  Succinivibrio     H   Source  
  Sutterella     H   Source  
  Syntrophomonas     H   Source  
  Variovorax     L   Source  
  Veillonella     H   Source  
 order    Bacteroidales     H   Source  
  Flavobacteriales     H   Source  
  Opitutales     H   Source  
 species    [Bacteroides] pectinophilus     L   Source  
  [Clostridium] asparagiforme     H   Source  
  [Clostridium] hylemonae     H   Source  
  [Clostridium] symbiosum     L   Source  
  [Hallella] seregens     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     H   Source  
  Abiotrophia sp.     L   Source  
  Acidaminococcus intestini     H   Source  
  ACM 3611     H   Source  
  Actinomyces naeslundii     L   Source  
  Akkermansia sp.     L   Source  
  Alistipes finegoldii     H   Source  
  Alistipes indistinctus     H   Source  
  Alistipes onderdonkii     H   Source  
  Alistipes putredinis     H   Source  
  Alistipes sp.     H   Source  
  Allisonella histaminiformans     H   Source  
  Alloprevotella rava     H   Source  
  Anaerococcus obesiensis     H   Source  
  Anaerococcus vaginalis     L   Source  
  Anaerostipes hadrus     L   Source  
  Anaerostipes sp.     L   Source  
  Anaerotruncus sp.     H   Source  
  Aquaspirillum dispar     H   Source  
  ATCC 13146 [[Leuconostoc amelibiosum Schillinger et al. 1989]]     L   Source  
  ATCC 25611     H   Source  
  ATCC 33110     H   Source  
  ATCC 35046     L   Source  
  ATCC 49918     H   Source  
  ATCC 700018     L   Source  
  ATCC 700907     H   Source  
  ATCC 8043     L   Source  
  ATCC BAA-960     L   Source  
  Bacterium sonnei Levine 1920     L   Source  
  Bacteroides barnesiae     H   Source  
  Bacteroides caccae     H   Source  
  Bacteroides clarus     L   Source  
  Bacteroides coprophilus     H   Source  
  Bacteroides dorei     H   Source  
  Bacteroides eggerthii     H   Source  
  Bacteroides faecis     H   Source  
  Bacteroides fluxus     H   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bacteroides gallinarum     H   Source  
  Bacteroides helcogenes     H   Source  
  Bacteroides intestinalis     L   Source  
  Bacteroides massiliensis     H   Source  
  Bacteroides nordii     H   Source  
  Bacteroides ovatus     H   Source  
  Bacteroides pyogenes     L   Source  
  Bacteroides reticulotermitis     H   Source  
  Bacteroides salyersiae     H   Source  
  Bacteroides sartorii     H   Source  
  Bacteroides sp.     H   Source  
  Bacteroides stercoris     H   Source  
  Bacteroides vulgatus     H   Source  
  Bacteroides xylanisolvens     H   Source  
  Barnesiella intestinihominis     H   Source  
  Bifidobacterium animalis     L   Source  
  Bifidobacterium pseudolongum     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Bifidobacterium sp.     L   Source  
  Bilophila wadsworthia     H   Source  
  Blautia hydrogenotrophica     H   Source  
  Blautia sp.     L   Source  
  Bradyrhizobium sp.     L   Source  
  Butyricicoccus pullicaecorum     H   Source  
  Butyricimonas sp.     L   Source  
  Butyricimonas virosa     H   Source  
  Campylobacter ureolyticus     H   Source  
  Candidatus Bacteroides periocalifornicus McLean et al. 2015     H   Source  
  Catabacter hongkongensis     H   Source  
  Catenibacterium sp.     H   Source  
  CCUG 45813     H   Source  
  CCUG 46149     H   Source  
  Cloacibacillus porcorum     H   Source  
  Clostridium celatum     H   Source  
  Clostridium perfringens     L   Source  
  Clostridium sp.     H   Source  
  Collinsella intestinalis     L   Source  
  Collinsella sp.     H   Source  
  Coprobacter fastidiosus     H   Source  
  Coprococcus eutactus     H   Source  
  Coprococcus sp.     L   Source  
  Cronobacter sakazakii     H   Source  
  CSUR P3241     H   Source  
  Desulfovibrio desulfuricans     H   Source  
  Desulfovibrio sp.     H   Source  
  Desulfovibrio vulgaris     H   Source  
  Dialister invisus     H   Source  
  Dialister pneumosintes     H   Source  
  Dialister sp.     H   Source  
  Dorea sp.     H   Source  
  DSM 103034     H   Source  
  DSM 20284     H   Source  
  DSM 8340     H   Source  
  Eisenbergiella sp.     H   Source  
  Emergencia sp.     H   Source  
  Enorma massiliensis     H   Source  
  Enorma sp.     H   Source  
  Enterococcus faecium     H   Source  
  Enterococcus sp.     L   Source  
  Escherichia sp.     H   Source  
  Eubacterium sp.     H   Source  
  Faecalibacterium sp.     H   Source  
  Faecalicoccus pleomorphus     H   Source  
  Flavonifractor plautii     H   Source  
  Flavonifractor sp.     H   Source  
  Fournierella sp.     H   Source  
  Fusobacterium nucleatum     H   Source  
  Fusobacterium nucleatum     H   Source  
  Fusobacterium nucleatum     L   Source  
  Fusobacterium sp.     H   Source  
  Gemella bergeri     H   Source  
  Haemophilus parainfluenzae     H   Source  
  Helicobacter pylori     H   Source  
  Holdemanella biformis     H   Source  
  Holdemanella sp.     L   Source  
  Holdemania filiformis     H   Source  
  Hungatella hathewayi     L   Source  
  Intestinimonas butyriciproducens     H   Source  
  Intestinimonas sp.     L   Source  
  Lachnospira pectinoschiza     H   Source  
  Lachnospira sp.     L   Source  
  Lactobacillus salivarius     L   Source  
  Leminorella grimontii     H   Source  
  Leptotrichia sp.     L   Source  
  Megasphaera micronuciformis     L   Source  
  Megasphaera sp.     H   Source  
  Merdibacter massiliensis     L   Source  
  Methanobrevibacter smithii     H   Source  
  Micromonas sp. (in: Bacteria)     H   Source  
  Mogibacterium sp.     H   Source  
  Negativicoccus massiliensis Togo et al. 2016     H   Source  
  Neglecta sp.     H   Source  
  Odoribacter laneus     H   Source  
  Odoribacter sp.     H   Source  
  Odoribacter splanchnicus     H   Source  
  Oscillibacter ruminantium     H   Source  
  Oscillibacter sp.     H   Source  
  Parabacteroides distasonis     H   Source  
  Parabacteroides johnsonii     H   Source  
  Parabacteroides merdae     H   Source  
  Parabacteroides sp.     H   Source  
  Paraprevotella clara     H   Source  
  Paraprevotella sp.     H   Source  
  Parvimonas micra     H   Source  
  Peptoniphilus sp.     H   Source  
  Peptostreptococcus anaerobius     H   Source  
  Peptostreptococcus sp.     H   Source  
  Peptostreptococcus stomatis     H   Source  
  Peptostreptococcus stomatis     H   Source  
  Phascolarctobacterium faecium     H   Source  
  Phascolarctobacterium sp.     H   Source  
  Porphyromonas asaccharolytica     H   Source  
  Porphyromonas asaccharolytica     H   Source  
  Porphyromonas catoniae     H   Source  
  Porphyromonas somerae     H   Source  
  Porphyromonas sp.     H   Source  
  Porphyromonas uenonis     H   Source  
  Prevotella copri     H   Source  
  Prevotella corporis     H   Source  
  Prevotella denticola     H   Source  
  Prevotella histicola     H   Source  
  Prevotella micans     H   Source  
  Prevotella oralis     H   Source  
  Prevotella saccharolytica     H   Source  
  Prevotella sp.     H   Source  
  Proteus vulgaris     H   Source  
  Pseudoflavonifractor capillosus     L   Source  
  Pseudoflavonifractor sp.     H   Source  
  Pseudoramibacter sp.     H   Source  
  Raoultella sp.     H   Source  
  Rikenella microfusus     H   Source  
  Rothia dentocariosa     L   Source  
  Ruminiclostridium sp.     L   Source  
  Ruminococcaceae bacterium D16     H   Source  
  Ruminococcus sp.     H   Source  
  Salmonella enterica     H   Source  
  Sanguibacteroides justesenii Sydenham et al. 2015     H   Source  
  Selenomonas artemidis     H   Source  
  Selenomonas sputigena     H   Source  
  Streptococcus dysgalactiae     H   Source  
  Streptococcus G418     L   Source  
  Streptococcus mitis     H   Source  
  Streptococcus sanguinis     L   Source  
  Streptococcus thermophilus     L   Source  
  Subdoligranulum sp.     H   Source  
  Subdoligranulum variabile     H   Source  
  Succinivibrio sp.     H   Source  
  Sutterella sp.     H   Source  
  Sutterella wadsworthensis     H   Source  
  Syntrophomonas sp.     H   Source  
  Tannerella forsythia     H   Source  
  Tyzzerella nexilis     H   Source  
  Variovorax sp.     L   Source  
  Veillonella dispar     L   Source  
  Veillonella sp.     H   Source  
  Victivallis vadensis     H   Source  
  VPI 5424     H   Source  
  Wolinella recta     H   Source  
  Yersinia ruckeri     H   Source  
Crohn's Disease   class    Clostridia     L   Source  
  Clostridia     L   Source  
 family    Aerococcaceae     H   Source  
  Christensenellaceae     L   Source  
  Enterobacteriaceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Abiotrophia     L   Source  
  Acetigenium     H   Source  
  Actinobacillus     H   Source  
  Akkermansia     L   Source  
  Anaerofustis     L   Source  
  Anaerostipes     L   Source  
  Bifidobacterium     H   Source  
  Blautia     L   Source  
  Burkholderia     H   Source  
  Butyrivibrio     L   Source  
  Campylobacter     L   Source  
  Catenibacterium     L   Source  
  Catenibacterium     L   Source  
  Cetobacterium     H   Source  
  Clostridium     H   Source  
  Collinsella     L   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Dehalobacterium     L   Source  
  Desulfovibrio     L   Source  
  Dorea     L   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Eubacterium     L   Source  
  Facklamia     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Jonquetella     H   Source  
  Klebsiella     L   Source  
  Lachnospira     L   Source  
  Lactobacillus     H   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Lactococcus     L   Source  
  Methanobrevibacter     L   Source  
  Mitsuokella     H   Source  
  Odoribacter     L   Source  
  Oscillibacter     L   Source  
  Paenibacillus     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Parasutterella     L   Source  
  Parvimonas     H   Source  
  Peptostreptococcus     H   Source  
  Porphyromonas     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Roseburia     L   Source  
  Ruminococcus     L   Source  
  Shigella     H   Source  
  Shigella     H   Source  
  Slackia     L   Source  
  Succinatimonas     H   Source  
  Sutterella     L   Source  
  Treponema     L   Source  
  Ulvina     L   Source  
  Vibrio     H   Source  
 order    Clostridiales     L   Source  
  Verrucomicrobiales     H   Source  
 phylum    Actinobacteria     H   Source  
  Bacteroidetes     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    [Clostridium] leptum     L   Source  
  [Eubacterium] rectale     L   Source  
  Bacteroides fragilis     L   Source  
  Bacteroides uniformis     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Blautia coccoides     L   Source  
  Blautia faecis     H   Source  
  Brucella tularensis     L   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Fusobacterium nucleatum     H   Source  
  Roseburia inulinivorans     H   Source  
  Roseburia sp.     L   Source  
cystic fibrosis   genus    Burkholderia     H   Source  
  Mycobacterium     H   Source  
  Pseudomonas     H   Source  
 phylum    Actinobacteria     H   Source  
 species    Blautia sp. Marseille-P2398     H   Source  
  Blautia sp. Marseille-P2398     H   Source  
  Pseudomonas aeruginosa group     H   Source  
  Stenotrophomonas maltophilia     H   Source  
  Stenotrophomonas maltophilia     H   Source  
Depression   class    Acidobacteriia     L   Source  
 family    Acidaminococcaceae     H   Source  
  Bacteroidaceae     H   Source  
  Enterobacteriaceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Porphyromonadaceae     H   Source  
  Rikenellaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
  Veillonellaceae     L   Source  
 genus    Alistipes     H   Source  
  Bacteroides     H   Source  
  Butyricimonas     H   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Dialister     L   Source  
  Escherichia     L   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Flavonifractor     H   Source  
  Haemophilus     L   Source  
  Oscillibacter     H   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Phascolarctobacterium     H   Source  
  Porphyromonas     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Roseburia     H   Source  
 order    Bacteroidales     H   Source  
  Bacteroidales     L   Source  
 phylum    Actinobacteria     L   Source  
  Firmicutes     L   Source  
  Fusobacteraeota     L   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    Brucella tularensis     L   Source  
Epilepsy   family    Lachnospiraceae     H   Source  
  Rikenellaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     H   Source  
 genus    Akkermansia     L   Source  
  Alistipes     H   Source  
  Barnesiella     H   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Cronobacter     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Erysipelatoclostridium     H   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Parabacteroides     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Ruminiclostridium     H   Source  
  Streptococcus     H   Source  
 order    Clostridiales     H   Source  
 phylum    Proteobacteria     H   Source  
 species    Akkermansia muciniphila     L   Source  
  Parabacteroides merdae     L   Source  
Fibromyalgia   family    Lachnospiraceae     L   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Alistipes     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bifidobacterium     L   Source  
  Butyricicoccus     H   Source  
  Clostridium     L   Source  
  Dorea     H   Source  
  Eubacterium     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Roseburia     H   Source  
 species    [Clostridium] scindens     H   Source  
  Alistipes onderdonkii     H   Source  
  Bacteroides uniformis     L   Source  
  Blautia faecis     L   Source  
  Blautia hydrogenotrophica     H   Source  
  Eisenbergiella tayi     H   Source  
  Erysipelatoclostridium ramosum     H   Source  
  Faecalibacterium prausnitzii     L   Source  
  Flavonifractor plautii     H   Source  
  Haemophilus parainfluenzae     L   Source  
  Hungatella hathewayi     H   Source  
  Intestinimonas butyriciproducens     H   Source  
  Parabacteroides merdae     H   Source  
  Prevotella copri     L   Source  
Functional constipation / chronic idiopathic constipation   family    Ruminococcaceae     H   Source  
 genus    Alistipes     H   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Bacteroides     L   Source  
  Coprococcus     L   Source  
  Faecalibacterium     H   Source  
  Lachnospira     H   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Roseburia     L   Source  
 species    Alistipes finegoldii     L   Source  
  Bacteroides fragilis     H   Source  
  Bacteroides ovatus     H   Source  
  Bifidobacterium longum     H   Source  
  Methanobrevibacter smithii     H   Source  
Gastro-esophageal reflux disease (Gerd) including Barrett's esophagus   class    Fusobacteriia     H   Source  
  Spirochaetia     H   Source  
 genus    Campylobacter     H   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Granulicatella     H   Source  
  Haemophilus     H   Source  
  Helicobacter     L   Source  
  Moraxella     L   Source  
  Neisseria     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Rothia     H   Source  
  Rothia     H   Source  
  Streptococcus     L   Source  
  Streptococcus     L   Source  
  Veillonella     H   Source  
 phylum    Bacteroidetes     H   Source  
  Firmicutes     H   Source  
  Fusobacteraeota     H   Source  
  Fusobacteraeota     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
  Spirochaetae     H   Source  
 species    Lactobacillus fermentum     L   Source  
  Lactobacillus gasseri     L   Source  
  Lactobacillus reuteri     L   Source  
  Streptococcus mitis     H   Source  
Generalized anxiety disorder   genus    Aerococcus     H   Source  
  Enterococcus     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Escherichia     H   Source  
  Fusobacterium     H   Source  
  Shigella     H   Source  
  Shigella     H   Source  
  Vagococcus     H   Source  
 order    Bacteroidales     L   Source  
 phylum    Proteobacteria     H   Source  
  Proteobacteria     H   Source  
 species    [Ruminococcus] gnavus     H   Source  
  ATCC 15483     L   Source  
  Bifidobacterium longum     L   Source  
  Bifidobacterium pseudolongum     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  Lactobacillus mucosae     L   Source  
Gout   class    Anaerolineae     H   Source  
  Bacteroidia     H   Source  
  Chloroflexia     H   Source  
  Erysipelotrichia     H   Source  
  Negativicutes     H   Source  
 family    Anaerolineaceae     H   Source  
  Bacteroidaceae     H   Source  
  Erysipelotrichaceae     H   Source  
  Lachnospiraceae     L   Source  
  Nocardiaceae     H   Source  
  Porphyromonadaceae     H   Source  
  Ruminococcaceae     L   Source  
 genus    Coprococcus     L   Source  
  Erysipelatoclostridium     H   Source  
  Prescottia     H   Source  
 order    Anaerolineales     H   Source  
  Bacteroidales     H   Source  
  Erysipelotrichales     H   Source  
  Selenomonadales     H   Source  
 phylum    Bacteroidetes     H   Source  
  Fusobacteria     H   Source  
Graves' disease   family    Enterobacteriaceae     L   Source  
  Pasteurellaceae     H   Source  
  Prevotellaceae     H   Source  
  Rikenellaceae     L   Source  
  Veillonellaceae     L   Source  
 genus    Haemophilus     H   Source  
  Prevotella     H   Source  
 species    Haemophilus parainfluenzae     H   Source  
Hashimoto's thyroiditis   genus    Bacteroides     L   Source  
  Blautia     H   Source  
  Dorea     H   Source  
  Faecalibacterium     L   Source  
  Fusicatenibacter     H   Source  
  Lachnoclostridium     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Romboutsia     H   Source  
  Roseburia     H   Source  
 species    [Eubacterium] hallii     H   Source  
  [Ruminococcus] torques     H   Source  
  Klebsiella pneumoniae aerogenes     H   Source  
High Blood Pressure   genus    Acetobacteroides     H   Source  
  Acinetobacter     H   Source  
  Aeriscardovia     L   Source  
  Aestuariispira     H   Source  
  Akkermansia     H   Source  
  Alistipes     L   Source  
  Barnesiella     H   Source  
  Bilophila     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Blautia     L   Source  
  Butyricimonas     L   Source  
  Cellulosibacter     H   Source  
  Cellulosilyticum     L   Source  
  Christensenella     H   Source  
  Desulfovibrio     H   Source  
  Dialister     H   Source  
  Eisenbergiella     L   Source  
  Enterococcus     L   Source  
  Faecalitalea     H   Source  
  Geosporobacter     H   Source  
  Haemophilus     L   Source  
  Intestinimonas     H   Source  
  Lactobacillus     L   Source  
  Lactococcus     L   Source  
  Odoribacter     L   Source  
  Odoribacter     L   Source  
  Olsenella     L   Source  
  Oscillibacter     L   Source  
  Parabacteroides     H   Source  
  Paraprevotella     H   Source  
  Parasutterella     L   Source  
  Prevotella     L   Source  
  Proteiniborus     H   Source  
  Ruminococcus     H   Source  
  Staphylococcus     H   Source  
  Staphylococcus     L   Source  
  Succinivibrio     H   Source  
  Sutterella     H   Source  
  Vampirovibrio     H   Source  
  Weissella     H   Source  
 species    Bacteridium luteum     H   Source  
  JCM 1305     H   Source  
Histamine Issues   genus    Enterococcus     H   Source  
  Hafnia     H   Source  
  Morganella     H   Source  
  Proteus     H   Source  
  Pseudomonas     H   Source  
  Raoultella     H   Source  
 species    Aerobacter aerogenes     H   Source  
  Anaeromassilibacillus senegalensis     H   Source  
  ATCC 35469     H   Source  
  ATCC 49124     H   Source  
  Bacteroides sp. AN 5745     H   Source  
  Bifidobacterium adolescentis     H   Source  
  Bifidobacterium longum     H   Source  
  Bifidobacterium pseudocatenulatum     H   Source  
  Bifidobacterium saguini     H   Source  
  CIPP II     H   Source  
  DSM 24301     H   Source  
  Enterococcus faecalis     H   Source  
  Hafnia alvei     H   Source  
  Klebsiella pneumoniae aerogenes     H   Source  
  Lactobacillus fermentum     H   Source  
  Lactobacillus gasseri     H   Source  
  Lactobacillus salivarius     H   Source  
  Lactobacillus vaginalis     H   Source  
  LMG:7884     H   Source  
  Morganella morganii     H   Source  
  Phascolarctobacterium faecium     H   Source  
  Photobacterium damselae     H   Source  
  Proteus mirabilis Hauser 1885     H   Source  
  Proteus vulgaris     H   Source  
Histamine Issues From Ubiome   genus    Candidatus Soleaferrea     L   Source  
  Lactobacillus     L   Source